古人所谓芝类常泛指菇类，并不一定都是灵芝。20世纪90年代，菌物学家赵继鼎等人采用现代真菌类生物分类系统对《神农本草经》中所述六芝作了一些对比研究，结果指出，《神农本草经》中所述的六芝并非都是灵芝。

　　白芝：《从抱朴子》中描述其白者如截肪的特征看，可能是苦白蹄(又称药用层孔菌，药用拟层孔菌)，其盖面呈白色至灰白色，菌肉灰白色，近肉质，后期程酪质，味苦。中医用作健胃、发汗剂，药用价值极低。

　　黑芝：《抱朴子》中描述其特征为黑者如泽漆，与其相对应得种类可能是假芝(又称乌芝)，其盖面呈褐色、暗褐色、黑褐色至黑色;并有黑色长柄。黑芝亦可能是黑柄多孔菌(又称黑柄仙盏)，盖面初期近白色，渐变为茶褐色，有表面黑褐色至黑色的长柄。

　　紫芝：应是紫灵芝(紫芝)，其盖面呈紫褐色、紫黑色至近黑色，具漆样光泽。有药用价值，是《中华人民共和国药典(一部)》收载的中药品种。现今灵芝研究证明，六芝其实只有五芝，赤芝与紫芝是同一品种。