中毒
动物在因被宰杀而痛苦挣扎时，身心处于极度的恐惧之中，其体内的生化环境会随之而产生很大变化。全身会立即布满各种有毒的副产品，污染了整个尸体。《大英百科全书》中指出：动物尸体的血液和组织中含有许多有毒物质，包括尿酸和其它有害的废物，而“坚果，豆类(如扁豆和豌豆等)，谷物及乳制品中的蛋白质要比牛肉纯洁得多。因为后者含有56%的污水。”
我们人在极度的恐惧和愤怒时，身体会处于病态之中。同样，动物在危险的处境，体内出会发生强烈的生化反应。当动物在同伴的尸堆中为求生而竭力挣扎时，血液中的激素(特别是肾上腺素)水平会急剧改变。这些大量的激素留在肉里，会破坏食肉者的人体组织。美国营养学会(NIA)曾指出：“动物尸体的肉里充满着有毒的血和其它废物。”
近来，科学家还发现，有些猪患有跗性的“紧张感”。这种神经衰弱的猪，如果在恶劣环境(例如高温)下饲养或屠宰时受到过度的刺激，其体内的部分蛋白质就会变性，形成“闷肉”，其肉色发白，有很多水滴，是一种异常肉。单纯追求生产率的密集饲养法使这种患有“紧张感”的猪越来越多。

癌症
有人曾对5万个素食者(基督教基督复临派的信徒)进行了研究，其结果令世界癌症专家们大为震惊。那些人的癌症发病率极低，包括所有年龄组和不同性别的人各种癌症的发病率都如此。此处，那些人的寿命也长得多。在对美国加州摩门(Mormon)教徒的研究中发现，他们癌症的发病率为人口总平均值的一半。摩门教徒几乎不吃肉。
为什么吃肉的人容易患癌症？其中一个原因是：肉类在存放几天之后会变成灰绿色，看起来让人恶心。肉类食品工业为了对此加以掩饰，就添加硝酸盐、亚硝酸盐及其它发色剂以保持肉的鲜红色。而研究证实， 亚硝酸钠（亚硝酸盐的一种）与某些食物中含有的胺类物质发生反应生成的硝胺是一种较强的致癌物质。美国食品与医药管理局(FDA)曾警告食品加工厂：“由于亚硝酸钠有可能与食品中其他物质反应生成致癌物质，希望停止使用。”美国田纳西州橡树岭（Oak Ridge）国家实验室的一位癌症专家威廉·李金斯基(W. Lijinsk)曾说：“我甚至不会把满是硝酸盐的食物喂给自己的猫吃。”
另处，有研究表明，饮食中过多摄入脂肪(特别是动物脂肪)的人，其乳腺癌，前列腺癌与大肠癌的发病率较高。肉食是典型的高脂肪食物，即使是纯瘦肉中也含有大量的不可见脂肪，所以，吃肉多的人其脂肪（包括胆固醇）的摄入量也会很多。过去在日本,乳腺癌比 较少见，而在美国则较常见。但是，移民到美国的日本人妇女其乳腺癌的发病率则与美国总人口的发病率相当。传统的日本饮食中肉食比美国要少，因而摄入的胆固醇也少。随着日本人的饮食习惯逐渐西方化，日本人妇女的乳腺癌的发病率也在不断提高。同样，结肠癌也是在日本比较少见，而多见于美国。但是，移民到美国的日本人也同美国人一样易患结肠癌。英美科学家曾对肉食者和素食者肠内的细菌做过研究，发现在两者有明显的不同。食肉者肠内的细菌与消化液发生反应可以致癌。这也许就是为什么，食肉多的地区，例如北美和西欧，肠癌泛滥，而以素食为主的国家，例如印度，则肠癌很少。在美国，肠癌是仅次于肺癌的第二大高发癌症。又如苏格兰人牛肉的食用量比英格兰人多20%，其肠癌的发病率为全球之冠。

化学污染
在自然界里，有一条长长的食物链：植物“吃”阳光，空气和水，动物吃植物，大动物或人吃小动物等。吃肉被认为是吃“食物链上的顶端”。
当今世界，环境污染问题日趋严重，所有的农田，牧场和水域都已都已被各种有害的化学物质所污染。这些污染物质有农药，化肥，各种有机和无机的化合物以及其它的工业污染等。动物对环境及食物中的污染物质优很强的“富集作用”。也就是说，动物通过吃大量的植物而使有害物质大量地积存于体内，其体内有害物质的浓度往往比环境及食物中的要高。例如，据调查，中国浙江省萧山县某池塘养殖的各种鱼通过吃水中的藻类及浮游生物等而使鱼肉中的一种杀虫剂六六六的浓度比池塘水高十几倍到八十多倍。又如，在农田中喷洒的DDT，是一种剧毒物质，能引发癌症、不育症及严重的肝病。DDT能溶于动物的脂肪中，而且一旦贮存其中就很难分解。因此，牛吃草或其它饲料时，所吃进的DDT及类似的农药大部分会留在体内。所以，当你吃动物时，动物在一生中所吃进的农药大部分都会被你吃下去。由此可见，在整个食物链中，最高的消费者往往是最大的受害者。因而，一个人如果成为食物链中最高的消费者——吃肉者时，那么其体内的农药含量也一定是最高的。实际上，动物体内DDT的含量是蔬菜，水果和草的13倍。美国衣阿华州立大学的实验证实，人体内的DDT大部分来源于肉食。
肉中的毒物还远不止于此。在肉食加工过程中，肉类食品被添加了各种抗氧化剂，发色剂，防腐剂，色素，品质改良剂和香料等添加剂。以“改善”肉的色质和品味。牲畜在饲养过程中也被施用了许多化学药物，以使之加速生长和繁殖。为了最大限度地提高产肉量以获取更多的利润，牲畜被强迫喂食，注射激素以刺激生长，并服用开胃刺激药，搞生素，搞寄生虫药，镇静剂及化学混合饲料等。1971年7月18日的《纽约时报》报道：“对消费者最大的潜在危害是那些看不见的污染物：沙门氏菌（一种可致病的肠杆菌），以及农药，硝酸盐，亚硝酸盐，激素，抗生素和其它化学药品的残留物。”这些物质大多为致癌或致畸物质。实际上，许多牲畜在宰杀之前就已经死于这些物质了。
自从过去的农场演变成今天的饲养工厂之后，牲畜们再也没有见到过阳光。它们在拥挤压迫的恶劣环境里生活着，等待着最终的屠杀。所谓的高效养鸡厂就是一个很好的例证。据美国《芝加哥论坛》报的文章描述：在养鸡厂中，鸡蛋在顶层孵化；幼鸡被施用刺激药和麻醉药，并被强迫喂食；且呼吸不到新鲜的空气。每当它们长大一些，就被宰杀。这种违备自然的饲养方式不但使鸡的体内生理失衡，而且也扭曲了它们的自然习性。因此，它们经常生患恶习性肿瘤及生长畸形。

动物疾病
肉食的另一个危害是，牲畜经常患病，且经常被肉厂及检验人员所忽略。若牲畜生了癌或肿瘤，则经常只是把病患部位切除，其余整个尸体照样出售。更有甚者， 那些被切除下来的“病肉”，会被用来制作香肠或热狗(一种红肠面包)等，并美名其曰为“杂碎肉”（“PARTS”）。在美国的某个地区，尽管有例行的检验程序以监督牲畜的屠宰，但是有一次竟然会有25000头患眼癌的牛被一次性出售。
某些肉制品，例如肉松，由于加工过程中热处理时间较长，因而被充许使用某些病畜肉作为原料，这种肉被称为“条件食用肉”，即在一定条件下进行“无害化”处理之后可供食用的肉。所谓无害化处理，一般为高温加热，药物消毒，盐腌或切除病患部位等。例如，经无害化处理充许销售的病畜有：患有口蹄疫，布氏杆菌病和非全身牲结核病的牲畜，以及患有水泡病和轻度猪瘟，猪丹毒和猪肺疫的猪等。
一次，著名的素食医生凯洛格博士(Dr. J. H. Kellogg)在一桌素席前曾这样说：“我们进食时无须顾虑所吃的食物因患何病而死，这是多么愉快的事啊!”

心脏病
大量的科学文献证实，人吃肉可以导致心脏病。这也许是倡导素食的最有力的一个论据。美国是世界上人均肉食消费量最多的国家。 在这个国家里，有四分之一的成年人血胆固醇值高于正常水平；每年约有150万人出现心肌梗塞，并造成50万例死亡；每年的死亡人数中有一半以上是死于“心血管病”，也就是说，在两个美国人当中肯定有一个要死于心血管病。而在肉食消费量很少的国家，这类病症则很少发生。《美国医学协会会刊》(JAMA)早在1961年就曾指出：“吃素可预防90-97%的心脏病(血栓及冠状动动脉阻塞)。”
为什么肉食对循环系统有这么大伤害呢？因为，动物脂肪（如胆固醇）在人体内不易分解，会逐渐沉积在血管内壁上；因而随着年岁的增长，血管内径会越来越小，血液流通也会越来越困难。这种危险的情况称之为动脉硬化。由于血液流不畅，心脏被迫更加努力地压送血液，从而大大加重了心脏的负担。其结果导致了高血压，中风和突发性心脏病等。美国哈佛大学的科学家们通过调查发现，素食者的血压明显低于相同背景的肉食者。朝鲜战争期间，有200个美军阵亡士兵的尸体曾被解剖检验，他们的平均年龄约为22岁。结果发现，他们之中近80%的人动脉已经硬化，凝结着许多脂肪。在检验相同年龄组韩国士兵的尸体时，发现他们的血管并无硬化现象。韩国人基本上是素食的。
现在，心脏病已经被公认为仅次于瘟疫的头号“杀手”。越来越多的医生，以及美国心脏病协会（AHA），主张限制心脏病患者的食肉量或告诫他们停止食肉。现在科学家认为，素食中的纤维素可以降低胆固醇。美国加州洛马琳达（Loma Linda）大学营养学系主任雷洁斯特博士（Dr. U. D. Register）的实验证实，多吃豆类可以降低胆固醇，即使吃大量黄油也无问题。

胆结石
科学家们认为，胆结石的形成与摄入动物脂肪（胆固醇）过多有关。正如前文所述，人体处理胆固醇的能力极为有限，摄入过多的胆固醇，则会使胆汁中胆固醇的浓度呈饱和状态，最终导致胆固醇在胆囊中沉积。天长日久，则会在胆囊中或胆管壁上形成胆固醇结石或其它结石，统称为胆结石。另外，胆结石极容易并发胆囊炎。医生们一般都告诫此类病人少吃或不吃富含胆固醇的肉食。医生们还认为，植物油中的必需脂肪酸以及膳食纤维可以提高人体处理胆固醇的能力。所以医生们还建议此类病人适当增加植物油的摄取，以及多吃蔬菜，粗粮等富含纤维素的食物。

肉质腐败
牲畜一经屠宰，其尸体中的蛋白质便开始凝固，并分泌一些自我分解的酶（植物有坚硬的细胞壁及简单的循环系统因而不易腐烂）。不久，便形成一种称之为尸碱（或称尸毒）的变性物质。由于动物死后这种尸碱形成得很快，使肉，鱼和蛋等分解腐烂得极快。所以，当动物经屠宰，冷藏，熟化，运往商店，采购，拿回家，贮藏，烹调，最后食用，直到我们入口时，可以想象已经腐败到什么程度。
正如前文中所提到的那样，我们的消化系统不适于消化肉食。肉食在人的消化道中移动得很慢，需经五天才能排出体外（素食则仅需一天半）。其间，腐烂的肉食所产生的有害物质不断地损害着消化器官。充满各种分解物质的肉食会在食肉者的结肠中产生一种毒性环境，使其过早损坏。
生肉是处于腐烂状态的物质，会玷污厨师的手及其它任何被接触到的东西。 英国卫生官员在一次发生在屠宰厂的突发性食物中毒事件之后，曾告诫家庭主妇们说：“接触生肉时要视之如同牛粪”。烹调过程经常是杀不死病菌的，特别是未熟透或经烧烤的肉食经常引发病患。

肾病 痛风 关节炎
肉食中最突出的废物之一是尿素和尿酸（氮化物）。例如，每磅牛排约14克尿酸（含量3%）。一位美国医生曾通过分析肉食者和素食者的尿液发现，为了排泄肉食中有害的氮化物，食肉者肾脏的工作量是素食者的3倍。
人在年轻时，通常还能应付这种额外的负担而无明显的损伤和病症。但是，随着年龄的增长，当肾脏开始老化或早衰时，它们就不再会有效地工作了，其结果常导致肾病。
当肾脏再也无法应付这些肉食中的废物时，尿酸将得不到有效的排泄，并在全身各处积存。它们会被肌肉象海绵一样地吸收，不久还会硬化和结晶。当这一切发生在关节处时，将患痛风，关节炎和风湿病。当它们侵害神经系统时，将患神经炎及坐骨神经痛。现在，许多医生都告诫这类病人要停止吃肉或大幅度减少食肉量。

排泄不良
由于我们的消化系统不是为肉食设计的，所以，吃肉很容易引起排泄不良。肉食因纤维含量极少，是浓缩性蛋白食物，在消化道中移动得很慢（约四倍于谷物和蔬菜食物），从而导致了社会上许多人所共有的苦恼——慢性便秘。
大量的研究证实，健康地排泄需要粗纤维，这些只能从素食中获得。与肉食不同，蔬菜，谷物，水果等容易保有水份及含有粗纤维，很容易在肠内通过。素食含有丰富的天然食物纤维，且能有效地预防相应的疾病。根据最新的研究结果， 天然纤维可以预防阑尾炎，憩室炎，结肠癌，胆结石，心脏病，肥胖症，糖尿病以及痔疮等。